基礎体温はホルモンバランスを表す指標の一つになります。
サプリメントによっては、ホルモンバランスに働きかける作用を持つものもあります。その場合、飲み始めて3周期ぐらいはホルモンバランスが揺らぐこともあります。これは一時的なもので体の慣らし運転が終われば安定してきます。
3周期を過ぎても基礎体温が安定しない場合は、服用量の増減など調整を行います。しばらくは観察を続けてみてください。